Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKAA2P54646 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRKAA2P54646 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKAA2P54646 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKAA2P54646 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKAA2P54646 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRKAA2P54646 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKAA2P54646 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKAA2P54646 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms