Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMS2P54278 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMS2P54278 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PMS2P54278 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PMS2P54278 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PMS2P54278 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PMS2P54278 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMS2P54278 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMS2P54278 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMS2P54278 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PMS2P54278 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PMS2P54278 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PMS2P54278 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PMS2P54278 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PMS2P54278 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PMS2P54278 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PMS2P54278 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PMS2P54278 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PMS2P54278 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PMS2P54278 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PMS2P54278 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PMS2P54278 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PMS2P54278 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PMS2P54278 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PMS2P54278 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PMS2P54278 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PMS2P54278 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PMS2P54278 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PMS2P54278 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PMS2P54278 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PMS2P54278 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PMS2P54278 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PMS2P54278 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PMS2P54278 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PMS2P54278 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PMS2P54278 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PMS2P54278 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PMS2P54278 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PMS2P54278 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PMS2P54278 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PMS2P54278 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PMS2P54278 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS2P54278 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS2P54278 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS2P54278 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS2P54278 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PMS2P54278 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMS2P54278 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMS2P54278 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PMS2P54278 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PMS2P54278 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PMS2P54278 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS2P54278 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS2P54278 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PMS2P54278 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PMS2P54278 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PMS2P54278 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMS2P54278 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PMS2P54278 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS2P54278 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PMS2P54278 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS2P54278 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PMS2P54278 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS2P54278 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS2P54278 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS2P54278 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PMS2P54278 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS2P54278 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS2P54278 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PMS2P54278 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMS2P54278 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PMS2P54278 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS2P54278 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PMS2P54278 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS2P54278 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PMS2P54278 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PMS2P54278 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS2P54278 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS2P54278 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS2P54278 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PMS2P54278 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS2P54278 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMS2P54278 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS2P54278 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS2P54278 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMS2P54278 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMS2P54278 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms