Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNHP51946 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNHP51946 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNHP51946 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNHP51946 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNHP51946 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNHP51946 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNHP51946 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNHP51946 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNHP51946 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNHP51946 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNHP51946 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNHP51946 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNHP51946 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNHP51946 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNHP51946 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNHP51946 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNHP51946 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNHP51946 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNHP51946 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNHP51946 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNHP51946 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNHP51946 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNHP51946 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNHP51946 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNHP51946 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNHP51946 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNHP51946 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNHP51946 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNHP51946 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNHP51946 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNHP51946 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNHP51946 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNHP51946 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNHP51946 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNHP51946 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNHP51946 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNHP51946 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNHP51946 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNHP51946 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNHP51946 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNHP51946 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNHP51946 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNHP51946 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNHP51946 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNHP51946 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNHP51946 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNHP51946 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNHP51946 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNHP51946 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNHP51946 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNHP51946 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNHP51946 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNHP51946 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNHP51946 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNHP51946 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNHP51946 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNHP51946 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNHP51946 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNHP51946 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNHP51946 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNHP51946 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CCNHP51946 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCNHP51946 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCNHP51946 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNHP51946 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNHP51946 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNHP51946 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCNHP51946 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNHP51946 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNHP51946 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNHP51946 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCNHP51946 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNHP51946 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNHP51946 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCNHP51946 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNHP51946 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNHP51946 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNHP51946 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNHP51946 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCNHP51946 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNHP51946 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCNHP51946 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNHP51946 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNHP51946 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCNHP51946 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNHP51946 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNHP51946 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNHP51946 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCNHP51946 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCNHP51946 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNHP51946 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCNHP51946 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms