Protein–RNA interactions for Protein: P51686

CCR9, C-C chemokine receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR9P51686 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR9P51686 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR9P51686 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR9P51686 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR9P51686 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR9P51686 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR9P51686 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR9P51686 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR9P51686 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR9P51686 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR9P51686 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR9P51686 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR9P51686 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR9P51686 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR9P51686 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR9P51686 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR9P51686 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR9P51686 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR9P51686 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR9P51686 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR9P51686 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR9P51686 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR9P51686 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR9P51686 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR9P51686 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR9P51686 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR9P51686 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR9P51686 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR9P51686 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR9P51686 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR9P51686 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR9P51686 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR9P51686 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR9P51686 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR9P51686 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR9P51686 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR9P51686 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR9P51686 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR9P51686 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR9P51686 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR9P51686 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR9P51686 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR9P51686 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR9P51686 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR9P51686 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR9P51686 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR9P51686 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR9P51686 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR9P51686 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCR9P51686 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR9P51686 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR9P51686 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR9P51686 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR9P51686 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR9P51686 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR9P51686 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR9P51686 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR9P51686 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR9P51686 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR9P51686 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR9P51686 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR9P51686 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR9P51686 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR9P51686 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR9P51686 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR9P51686 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR9P51686 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR9P51686 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCR9P51686 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR9P51686 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR9P51686 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR9P51686 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR9P51686 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR9P51686 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR9P51686 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR9P51686 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR9P51686 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCR9P51686 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR9P51686 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR9P51686 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR9P51686 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR9P51686 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR9P51686 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR9P51686 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR9P51686 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR9P51686 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR9P51686 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR9P51686 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR9P51686 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR9P51686 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR9P51686 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR9P51686 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR9P51686 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR9P51686 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms