Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDKN1CP49918 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDKN1CP49918 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDKN1CP49918 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDKN1CP49918 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDKN1CP49918 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDKN1CP49918 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDKN1CP49918 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms