Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR4A2P43354 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NR4A2P43354 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NR4A2P43354 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NR4A2P43354 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NR4A2P43354 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR4A2P43354 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms