Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CASRP41180 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASRP41180 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASRP41180 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASRP41180 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASRP41180 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASRP41180 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASRP41180 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASRP41180 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASRP41180 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASRP41180 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASRP41180 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASRP41180 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CASRP41180 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASRP41180 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASRP41180 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASRP41180 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CASRP41180 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASRP41180 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASRP41180 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASRP41180 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASRP41180 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASRP41180 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASRP41180 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASRP41180 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASRP41180 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASRP41180 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CASRP41180 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASRP41180 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASRP41180 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASRP41180 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASRP41180 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASRP41180 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASRP41180 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASRP41180 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASRP41180 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASRP41180 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASRP41180 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASRP41180 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASRP41180 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASRP41180 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASRP41180 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASRP41180 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASRP41180 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASRP41180 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASRP41180 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASRP41180 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASRP41180 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASRP41180 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASRP41180 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASRP41180 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASRP41180 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CASRP41180 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASRP41180 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASRP41180 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASRP41180 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASRP41180 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASRP41180 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASRP41180 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASRP41180 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASRP41180 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASRP41180 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASRP41180 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CASRP41180 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASRP41180 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASRP41180 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASRP41180 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASRP41180 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASRP41180 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASRP41180 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASRP41180 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASRP41180 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASRP41180 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASRP41180 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASRP41180 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASRP41180 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASRP41180 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASRP41180 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASRP41180 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASRP41180 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASRP41180 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASRP41180 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASRP41180 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASRP41180 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASRP41180 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASRP41180 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASRP41180 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASRP41180 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms