Protein–RNA interactions for Protein: P35713

SOX18, Transcription factor SOX-18, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX18P35713 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOX18P35713 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX18P35713 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX18P35713 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOX18P35713 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX18P35713 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOX18P35713 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX18P35713 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX18P35713 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX18P35713 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOX18P35713 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX18P35713 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX18P35713 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX18P35713 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX18P35713 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX18P35713 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX18P35713 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX18P35713 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX18P35713 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX18P35713 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX18P35713 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX18P35713 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX18P35713 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX18P35713 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX18P35713 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX18P35713 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX18P35713 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX18P35713 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX18P35713 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX18P35713 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX18P35713 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX18P35713 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX18P35713 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX18P35713 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX18P35713 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX18P35713 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX18P35713 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX18P35713 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX18P35713 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX18P35713 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX18P35713 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX18P35713 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX18P35713 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX18P35713 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX18P35713 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX18P35713 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX18P35713 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX18P35713 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX18P35713 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX18P35713 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX18P35713 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX18P35713 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX18P35713 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX18P35713 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX18P35713 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX18P35713 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX18P35713 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX18P35713 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX18P35713 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX18P35713 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX18P35713 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX18P35713 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX18P35713 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX18P35713 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX18P35713 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX18P35713 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX18P35713 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX18P35713 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX18P35713 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX18P35713 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX18P35713 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX18P35713 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX18P35713 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX18P35713 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX18P35713 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX18P35713 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX18P35713 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX18P35713 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX18P35713 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX18P35713 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX18P35713 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX18P35713 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX18P35713 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX18P35713 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX18P35713 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX18P35713 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX18P35713 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX18P35713 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX18P35713 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX18P35713 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX18P35713 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX18P35713 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX18P35713 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms