Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RCVRNP35243 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RCVRNP35243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RCVRNP35243 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RCVRNP35243 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCVRNP35243 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCVRNP35243 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RCVRNP35243 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms