Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GBP2P32456 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GBP2P32456 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GBP2P32456 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP2P32456 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP2P32456 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP2P32456 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP2P32456 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP2P32456 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP2P32456 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP2P32456 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP2P32456 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP2P32456 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GBP2P32456 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP2P32456 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP2P32456 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP2P32456 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP2P32456 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP2P32456 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP2P32456 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GBP2P32456 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP2P32456 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP2P32456 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP2P32456 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP2P32456 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP2P32456 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP2P32456 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP2P32456 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP2P32456 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP2P32456 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP2P32456 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP2P32456 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GBP2P32456 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP2P32456 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP2P32456 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP2P32456 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP2P32456 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP2P32456 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP2P32456 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP2P32456 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP2P32456 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP2P32456 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP2P32456 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP2P32456 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBP2P32456 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP2P32456 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP2P32456 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP2P32456 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP2P32456 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP2P32456 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP2P32456 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP2P32456 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP2P32456 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP2P32456 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP2P32456 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP2P32456 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP2P32456 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP2P32456 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP2P32456 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP2P32456 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP2P32456 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP2P32456 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP2P32456 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP2P32456 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP2P32456 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP2P32456 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP2P32456 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP2P32456 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP2P32456 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP2P32456 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP2P32456 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP2P32456 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBP2P32456 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP2P32456 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP2P32456 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP2P32456 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP2P32456 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP2P32456 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP2P32456 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GBP2P32456 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP2P32456 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP2P32456 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP2P32456 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP2P32456 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP2P32456 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GBP2P32456 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP2P32456 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP2P32456 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP2P32456 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP2P32456 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP2P32456 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP2P32456 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP2P32456 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP2P32456 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP2P32456 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP2P32456 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP2P32456 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GBP2P32456 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP2P32456 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP2P32456 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms