Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC5P28715 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC5P28715 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERCC5P28715 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERCC5P28715 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ERCC5P28715 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ERCC5P28715 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ERCC5P28715 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ERCC5P28715 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ERCC5P28715 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms