Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPA1P27694 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPA1P27694 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RPA1P27694 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPA1P27694 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RPA1P27694 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPA1P27694 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPA1P27694 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPA1P27694 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPA1P27694 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPA1P27694 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPA1P27694 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPA1P27694 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPA1P27694 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPA1P27694 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPA1P27694 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPA1P27694 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RPA1P27694 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RPA1P27694 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPA1P27694 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPA1P27694 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RPA1P27694 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RPA1P27694 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPA1P27694 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPA1P27694 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RPA1P27694 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPA1P27694 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPA1P27694 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPA1P27694 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RPA1P27694 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RPA1P27694 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPA1P27694 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RPA1P27694 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RPA1P27694 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPA1P27694 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPA1P27694 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPA1P27694 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RPA1P27694 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RPA1P27694 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPA1P27694 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPA1P27694 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPA1P27694 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPA1P27694 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPA1P27694 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPA1P27694 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RPA1P27694 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RPA1P27694 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPA1P27694 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RPA1P27694 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPA1P27694 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RPA1P27694 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPA1P27694 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RPA1P27694 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPA1P27694 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPA1P27694 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RPA1P27694 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RPA1P27694 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RPA1P27694 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RPA1P27694 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPA1P27694 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPA1P27694 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RPA1P27694 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPA1P27694 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RPA1P27694 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPA1P27694 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RPA1P27694 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPA1P27694 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RPA1P27694 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RPA1P27694 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPA1P27694 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPA1P27694 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPA1P27694 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPA1P27694 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPA1P27694 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RPA1P27694 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RPA1P27694 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPA1P27694 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPA1P27694 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RPA1P27694 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA1P27694 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPA1P27694 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RPA1P27694 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RPA1P27694 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPA1P27694 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPA1P27694 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPA1P27694 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPA1P27694 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPA1P27694 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RPA1P27694 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPA1P27694 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RPA1P27694 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RPA1P27694 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RPA1P27694 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RPA1P27694 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms