Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
HRCP23327 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
HRCP23327 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
HRCP23327 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.3■■■■■ 4.2
HRCP23327 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
HRCP23327 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HRCP23327 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
HRCP23327 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
HRCP23327 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
HRCP23327 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HRCP23327 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HRCP23327 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
HRCP23327 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
HRCP23327 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
HRCP23327 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HRCP23327 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
HRCP23327 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
HRCP23327 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
HRCP23327 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
HRCP23327 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
HRCP23327 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
HRCP23327 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
HRCP23327 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HRCP23327 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
HRCP23327 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
HRCP23327 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
HRCP23327 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
HRCP23327 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
HRCP23327 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
HRCP23327 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC41.09■■■■■ 4.17
HRCP23327 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
HRCP23327 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
HRCP23327 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
HRCP23327 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
HRCP23327 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
HRCP23327 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HRCP23327 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.03■■■■■ 4.16
HRCP23327 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
HRCP23327 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
HRCP23327 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
HRCP23327 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
HRCP23327 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
HRCP23327 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
HRCP23327 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
HRCP23327 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41■■■■■ 4.15
HRCP23327 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
HRCP23327 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
HRCP23327 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
HRCP23327 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
HRCP23327 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
HRCP23327 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
HRCP23327 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
HRCP23327 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
HRCP23327 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
HRCP23327 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
HRCP23327 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
HRCP23327 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
HRCP23327 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
HRCP23327 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
HRCP23327 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
HRCP23327 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
HRCP23327 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
HRCP23327 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
HRCP23327 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
HRCP23327 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
HRCP23327 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
HRCP23327 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
HRCP23327 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HRCP23327 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HRCP23327 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HRCP23327 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
HRCP23327 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HRCP23327 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
HRCP23327 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
HRCP23327 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
HRCP23327 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
HRCP23327 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
HRCP23327 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
HRCP23327 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HRCP23327 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
HRCP23327 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC40.79■■■■■ 4.12
HRCP23327 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
HRCP23327 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
HRCP23327 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
HRCP23327 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
HRCP23327 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
HRCP23327 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
HRCP23327 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
HRCP23327 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
HRCP23327 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
HRCP23327 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
HRCP23327 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
HRCP23327 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
HRCP23327 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
HRCP23327 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
HRCP23327 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
HRCP23327 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
HRCP23327 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
HRCP23327 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
HRCP23327 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 656.7 ms