Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NR4A1P22736 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NR4A1P22736 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR4A1P22736 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NR4A1P22736 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR4A1P22736 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR4A1P22736 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.5 ms