Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGFR4P22455 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGFR4P22455 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FGFR4P22455 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FGFR4P22455 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FGFR4P22455 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
FGFR4P22455 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FGFR4P22455 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms