Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACO1P21399 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACO1P21399 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACO1P21399 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACO1P21399 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACO1P21399 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACO1P21399 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACO1P21399 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACO1P21399 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACO1P21399 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ACO1P21399 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACO1P21399 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACO1P21399 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACO1P21399 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACO1P21399 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACO1P21399 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACO1P21399 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ACO1P21399 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACO1P21399 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACO1P21399 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACO1P21399 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACO1P21399 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACO1P21399 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACO1P21399 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACO1P21399 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACO1P21399 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACO1P21399 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACO1P21399 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACO1P21399 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACO1P21399 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACO1P21399 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ACO1P21399 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACO1P21399 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACO1P21399 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACO1P21399 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACO1P21399 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACO1P21399 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACO1P21399 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ACO1P21399 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACO1P21399 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACO1P21399 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACO1P21399 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACO1P21399 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACO1P21399 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ACO1P21399 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACO1P21399 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACO1P21399 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACO1P21399 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACO1P21399 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACO1P21399 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACO1P21399 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACO1P21399 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACO1P21399 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACO1P21399 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACO1P21399 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ACO1P21399 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACO1P21399 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACO1P21399 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACO1P21399 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACO1P21399 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACO1P21399 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ACO1P21399 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACO1P21399 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACO1P21399 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACO1P21399 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACO1P21399 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACO1P21399 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACO1P21399 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACO1P21399 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACO1P21399 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACO1P21399 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACO1P21399 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACO1P21399 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACO1P21399 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ACO1P21399 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACO1P21399 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACO1P21399 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACO1P21399 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACO1P21399 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACO1P21399 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACO1P21399 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACO1P21399 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACO1P21399 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACO1P21399 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACO1P21399 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ACO1P21399 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACO1P21399 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACO1P21399 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACO1P21399 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACO1P21399 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACO1P21399 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ACO1P21399 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACO1P21399 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACO1P21399 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ACO1P21399 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ACO1P21399 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACO1P21399 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ACO1P21399 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACO1P21399 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACO1P21399 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms