Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XBP1P17861 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
XBP1P17861 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
XBP1P17861 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
XBP1P17861 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
XBP1P17861 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
XBP1P17861 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
XBP1P17861 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XBP1P17861 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
XBP1P17861 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XBP1P17861 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
XBP1P17861 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
XBP1P17861 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
XBP1P17861 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
XBP1P17861 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
XBP1P17861 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
XBP1P17861 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
XBP1P17861 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
XBP1P17861 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
XBP1P17861 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XBP1P17861 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
XBP1P17861 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
XBP1P17861 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
XBP1P17861 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
XBP1P17861 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XBP1P17861 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
XBP1P17861 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
XBP1P17861 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
XBP1P17861 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
XBP1P17861 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
XBP1P17861 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
XBP1P17861 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
XBP1P17861 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
XBP1P17861 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
XBP1P17861 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
XBP1P17861 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
XBP1P17861 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
XBP1P17861 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XBP1P17861 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
XBP1P17861 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
XBP1P17861 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
XBP1P17861 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
XBP1P17861 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
XBP1P17861 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
XBP1P17861 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
XBP1P17861 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
XBP1P17861 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
XBP1P17861 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
XBP1P17861 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XBP1P17861 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
XBP1P17861 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
XBP1P17861 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
XBP1P17861 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
XBP1P17861 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
XBP1P17861 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
XBP1P17861 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
XBP1P17861 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
XBP1P17861 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
XBP1P17861 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
XBP1P17861 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
XBP1P17861 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
XBP1P17861 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XBP1P17861 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
XBP1P17861 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
XBP1P17861 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
XBP1P17861 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XBP1P17861 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XBP1P17861 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
XBP1P17861 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
XBP1P17861 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
XBP1P17861 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
XBP1P17861 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XBP1P17861 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
XBP1P17861 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
XBP1P17861 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
XBP1P17861 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
XBP1P17861 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
XBP1P17861 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
XBP1P17861 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
XBP1P17861 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
XBP1P17861 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
XBP1P17861 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
XBP1P17861 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
XBP1P17861 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
XBP1P17861 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
XBP1P17861 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
XBP1P17861 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
XBP1P17861 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
XBP1P17861 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
XBP1P17861 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XBP1P17861 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XBP1P17861 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
XBP1P17861 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
XBP1P17861 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
XBP1P17861 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
XBP1P17861 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
XBP1P17861 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
XBP1P17861 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
XBP1P17861 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
XBP1P17861 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms