Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKMT2P17540 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CKMT2P17540 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CKMT2P17540 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CKMT2P17540 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CKMT2P17540 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CKMT2P17540 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CKMT2P17540 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms