Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGA1P17096 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGA1P17096 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HMGA1P17096 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGA1P17096 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HMGA1P17096 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HMGA1P17096 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGA1P17096 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms