Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARGP13631 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARGP13631 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RARGP13631 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARGP13631 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARGP13631 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARGP13631 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARGP13631 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARGP13631 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARGP13631 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARGP13631 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARGP13631 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARGP13631 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARGP13631 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARGP13631 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARGP13631 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARGP13631 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARGP13631 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARGP13631 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARGP13631 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARGP13631 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARGP13631 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARGP13631 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARGP13631 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RARGP13631 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARGP13631 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARGP13631 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARGP13631 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARGP13631 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARGP13631 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RARGP13631 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RARGP13631 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARGP13631 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARGP13631 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARGP13631 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARGP13631 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARGP13631 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARGP13631 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARGP13631 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARGP13631 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARGP13631 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARGP13631 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARGP13631 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARGP13631 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARGP13631 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RARGP13631 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARGP13631 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARGP13631 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARGP13631 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARGP13631 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARGP13631 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARGP13631 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARGP13631 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARGP13631 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARGP13631 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARGP13631 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARGP13631 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARGP13631 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARGP13631 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARGP13631 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARGP13631 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARGP13631 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RARGP13631 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARGP13631 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARGP13631 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARGP13631 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARGP13631 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARGP13631 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARGP13631 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARGP13631 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RARGP13631 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RARGP13631 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RARGP13631 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARGP13631 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARGP13631 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARGP13631 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARGP13631 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARGP13631 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARGP13631 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARGP13631 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARGP13631 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARGP13631 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARGP13631 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARGP13631 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARGP13631 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARGP13631 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARGP13631 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARGP13631 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARGP13631 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARGP13631 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARGP13631 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RARGP13631 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARGP13631 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARGP13631 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARGP13631 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARGP13631 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARGP13631 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RARGP13631 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RARGP13631 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARGP13631 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms