Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSH2P0DML3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSH2P0DML3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSH2P0DML3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSH2P0DML3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CSH2P0DML3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms