Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RGPD1P0DJD0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RGPD1P0DJD0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RGPD1P0DJD0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RGPD1P0DJD0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RGPD1P0DJD0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
RGPD1P0DJD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RGPD1P0DJD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
RGPD1P0DJD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms