Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTXN2P0C2S0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTXN2P0C2S0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN2P0C2S0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CTXN2P0C2S0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTXN2P0C2S0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTXN2P0C2S0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms