Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1P09603 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1P09603 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1P09603 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF1P09603 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1P09603 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1P09603 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1P09603 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSF1P09603 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1P09603 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1P09603 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1P09603 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSF1P09603 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1P09603 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1P09603 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSF1P09603 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1P09603 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1P09603 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1P09603 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1P09603 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSF1P09603 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSF1P09603 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1P09603 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSF1P09603 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1P09603 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSF1P09603 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1P09603 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1P09603 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1P09603 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF1P09603 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1P09603 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1P09603 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF1P09603 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF1P09603 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1P09603 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF1P09603 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF1P09603 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1P09603 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1P09603 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF1P09603 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1P09603 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1P09603 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1P09603 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1P09603 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF1P09603 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1P09603 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1P09603 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF1P09603 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1P09603 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF1P09603 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF1P09603 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF1P09603 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1P09603 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1P09603 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1P09603 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1P09603 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF1P09603 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1P09603 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1P09603 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1P09603 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1P09603 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1P09603 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF1P09603 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF1P09603 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1P09603 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF1P09603 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1P09603 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1P09603 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF1P09603 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSF1P09603 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSF1P09603 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSF1P09603 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSF1P09603 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1P09603 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1P09603 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSF1P09603 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1P09603 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSF1P09603 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSF1P09603 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF1P09603 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF1P09603 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSF1P09603 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSF1P09603 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF1P09603 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF1P09603 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF1P09603 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSF1P09603 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSF1P09603 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms