Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXB5P09067 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB5P09067 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXB5P09067 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB5P09067 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB5P09067 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HOXB5P09067 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXB5P09067 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms