Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PFKMP08237 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PFKMP08237 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PFKMP08237 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PFKMP08237 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PFKMP08237 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PFKMP08237 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PFKMP08237 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PFKMP08237 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PFKMP08237 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PFKMP08237 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PFKMP08237 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PFKMP08237 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PFKMP08237 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PFKMP08237 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PFKMP08237 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PFKMP08237 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PFKMP08237 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PFKMP08237 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PFKMP08237 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PFKMP08237 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PFKMP08237 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PFKMP08237 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PFKMP08237 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PFKMP08237 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PFKMP08237 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PFKMP08237 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PFKMP08237 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PFKMP08237 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PFKMP08237 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PFKMP08237 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PFKMP08237 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PFKMP08237 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PFKMP08237 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PFKMP08237 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PFKMP08237 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PFKMP08237 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PFKMP08237 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PFKMP08237 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PFKMP08237 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PFKMP08237 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PFKMP08237 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PFKMP08237 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PFKMP08237 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PFKMP08237 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PFKMP08237 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PFKMP08237 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PFKMP08237 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PFKMP08237 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PFKMP08237 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PFKMP08237 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PFKMP08237 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PFKMP08237 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PFKMP08237 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PFKMP08237 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PFKMP08237 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PFKMP08237 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PFKMP08237 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PFKMP08237 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PFKMP08237 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PFKMP08237 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PFKMP08237 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PFKMP08237 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PFKMP08237 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PFKMP08237 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PFKMP08237 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PFKMP08237 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PFKMP08237 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PFKMP08237 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PFKMP08237 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PFKMP08237 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PFKMP08237 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PFKMP08237 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PFKMP08237 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PFKMP08237 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PFKMP08237 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PFKMP08237 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PFKMP08237 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PFKMP08237 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PFKMP08237 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PFKMP08237 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PFKMP08237 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PFKMP08237 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PFKMP08237 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PFKMP08237 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PFKMP08237 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PFKMP08237 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PFKMP08237 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PFKMP08237 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PFKMP08237 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PFKMP08237 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PFKMP08237 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PFKMP08237 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms