Protein–RNA interactions for Protein: P06729

CD2, T-cell surface antigen CD2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2P06729 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD2P06729 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD2P06729 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD2P06729 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2P06729 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2P06729 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD2P06729 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2P06729 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2P06729 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD2P06729 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD2P06729 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2P06729 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD2P06729 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2P06729 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD2P06729 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD2P06729 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD2P06729 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD2P06729 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CD2P06729 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD2P06729 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD2P06729 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD2P06729 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD2P06729 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD2P06729 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD2P06729 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2P06729 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2P06729 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2P06729 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2P06729 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2P06729 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD2P06729 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2P06729 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD2P06729 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2P06729 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2P06729 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD2P06729 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2P06729 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2P06729 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2P06729 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2P06729 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2P06729 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2P06729 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2P06729 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2P06729 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2P06729 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2P06729 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2P06729 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2P06729 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD2P06729 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD2P06729 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD2P06729 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD2P06729 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD2P06729 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD2P06729 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD2P06729 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD2P06729 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD2P06729 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD2P06729 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD2P06729 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD2P06729 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD2P06729 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD2P06729 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD2P06729 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD2P06729 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD2P06729 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD2P06729 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD2P06729 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD2P06729 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD2P06729 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD2P06729 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD2P06729 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD2P06729 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD2P06729 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD2P06729 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD2P06729 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CD2P06729 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD2P06729 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD2P06729 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD2P06729 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CD2P06729 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD2P06729 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD2P06729 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD2P06729 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD2P06729 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD2P06729 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD2P06729 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD2P06729 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD2P06729 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms