Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX3O95076 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX3O95076 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX3O95076 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX3O95076 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX3O95076 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX3O95076 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX3O95076 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX3O95076 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX3O95076 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX3O95076 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALX3O95076 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX3O95076 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALX3O95076 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX3O95076 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX3O95076 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX3O95076 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX3O95076 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX3O95076 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX3O95076 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX3O95076 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX3O95076 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX3O95076 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX3O95076 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX3O95076 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX3O95076 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX3O95076 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX3O95076 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX3O95076 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX3O95076 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX3O95076 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX3O95076 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX3O95076 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX3O95076 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX3O95076 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX3O95076 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX3O95076 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX3O95076 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX3O95076 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX3O95076 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX3O95076 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX3O95076 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX3O95076 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX3O95076 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX3O95076 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX3O95076 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX3O95076 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALX3O95076 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX3O95076 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX3O95076 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX3O95076 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX3O95076 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX3O95076 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALX3O95076 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALX3O95076 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX3O95076 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX3O95076 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX3O95076 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX3O95076 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX3O95076 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX3O95076 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX3O95076 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX3O95076 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX3O95076 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX3O95076 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX3O95076 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX3O95076 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX3O95076 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX3O95076 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALX3O95076 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX3O95076 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX3O95076 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX3O95076 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX3O95076 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX3O95076 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX3O95076 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX3O95076 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX3O95076 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX3O95076 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX3O95076 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX3O95076 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX3O95076 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX3O95076 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX3O95076 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX3O95076 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX3O95076 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX3O95076 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALX3O95076 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX3O95076 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX3O95076 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX3O95076 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX3O95076 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX3O95076 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALX3O95076 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms