Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT33AO76009 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRT33AO76009 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT33AO76009 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT33AO76009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT33AO76009 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT33AO76009 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms