Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1BO75688 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1BO75688 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPM1BO75688 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPM1BO75688 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PPM1BO75688 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPM1BO75688 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms