Protein–RNA interactions for Protein: O75569

PRKRA, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRAO75569 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKRAO75569 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKRAO75569 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKRAO75569 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRKRAO75569 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKRAO75569 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKRAO75569 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKRAO75569 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms