Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PMPCBO75439 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PMPCBO75439 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMPCBO75439 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PMPCBO75439 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMPCBO75439 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PMPCBO75439 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PMPCBO75439 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PMPCBO75439 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PMPCBO75439 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PMPCBO75439 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PMPCBO75439 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms