Protein–RNA interactions for Protein: O75387

SLC43A1, Large neutral amino acids transporter small subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A1O75387 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC43A1O75387 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC43A1O75387 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC43A1O75387 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC43A1O75387 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC43A1O75387 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC43A1O75387 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC43A1O75387 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms