Protein–RNA interactions for Protein: O60711

LPXN, Leupaxin, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPXNO60711 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LPXNO60711 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LPXNO60711 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LPXNO60711 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LPXNO60711 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LPXNO60711 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LPXNO60711 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LPXNO60711 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LPXNO60711 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LPXNO60711 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LPXNO60711 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPXNO60711 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPXNO60711 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LPXNO60711 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LPXNO60711 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LPXNO60711 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LPXNO60711 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LPXNO60711 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LPXNO60711 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
LPXNO60711 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LPXNO60711 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LPXNO60711 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LPXNO60711 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPXNO60711 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPXNO60711 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LPXNO60711 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPXNO60711 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LPXNO60711 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LPXNO60711 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LPXNO60711 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LPXNO60711 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LPXNO60711 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LPXNO60711 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LPXNO60711 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPXNO60711 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPXNO60711 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LPXNO60711 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LPXNO60711 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LPXNO60711 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LPXNO60711 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LPXNO60711 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LPXNO60711 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPXNO60711 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LPXNO60711 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LPXNO60711 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LPXNO60711 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LPXNO60711 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPXNO60711 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LPXNO60711 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPXNO60711 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPXNO60711 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LPXNO60711 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPXNO60711 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPXNO60711 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LPXNO60711 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LPXNO60711 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LPXNO60711 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPXNO60711 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LPXNO60711 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LPXNO60711 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPXNO60711 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPXNO60711 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LPXNO60711 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPXNO60711 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LPXNO60711 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms