Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNCRIPO60506 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYNCRIPO60506 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYNCRIPO60506 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYNCRIPO60506 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNCRIPO60506 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYNCRIPO60506 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYNCRIPO60506 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms