Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF3IP2O43734 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP2O43734 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAF3IP2O43734 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF3IP2O43734 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF3IP2O43734 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRAF3IP2O43734 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms