Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENRO43583 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENRO43583 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DENRO43583 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENRO43583 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENRO43583 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENRO43583 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENRO43583 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENRO43583 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENRO43583 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENRO43583 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENRO43583 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENRO43583 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENRO43583 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENRO43583 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENRO43583 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENRO43583 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENRO43583 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENRO43583 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DENRO43583 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DENRO43583 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENRO43583 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENRO43583 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DENRO43583 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENRO43583 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DENRO43583 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DENRO43583 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DENRO43583 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENRO43583 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENRO43583 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DENRO43583 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DENRO43583 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENRO43583 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DENRO43583 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENRO43583 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DENRO43583 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENRO43583 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DENRO43583 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DENRO43583 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENRO43583 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DENRO43583 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DENRO43583 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENRO43583 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DENRO43583 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DENRO43583 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENRO43583 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENRO43583 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DENRO43583 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENRO43583 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENRO43583 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENRO43583 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DENRO43583 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
DENRO43583 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENRO43583 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENRO43583 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DENRO43583 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENRO43583 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENRO43583 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DENRO43583 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENRO43583 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DENRO43583 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENRO43583 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENRO43583 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DENRO43583 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENRO43583 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DENRO43583 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DENRO43583 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DENRO43583 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENRO43583 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DENRO43583 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DENRO43583 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENRO43583 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENRO43583 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DENRO43583 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENRO43583 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENRO43583 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DENRO43583 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENRO43583 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENRO43583 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DENRO43583 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DENRO43583 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENRO43583 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENRO43583 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENRO43583 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DENRO43583 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DENRO43583 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENRO43583 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENRO43583 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DENRO43583 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DENRO43583 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENRO43583 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENRO43583 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENRO43583 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENRO43583 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENRO43583 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENRO43583 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENRO43583 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENRO43583 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENRO43583 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DENRO43583 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.2 ms