Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP8B1O43520 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP8B1O43520 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP8B1O43520 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP8B1O43520 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP8B1O43520 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP8B1O43520 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B1O43520 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP8B1O43520 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP8B1O43520 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8B1O43520 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP8B1O43520 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP8B1O43520 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B1O43520 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B1O43520 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B1O43520 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B1O43520 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP8B1O43520 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B1O43520 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B1O43520 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B1O43520 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B1O43520 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP8B1O43520 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP8B1O43520 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP8B1O43520 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B1O43520 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B1O43520 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B1O43520 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATP8B1O43520 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP8B1O43520 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ATP8B1O43520 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP8B1O43520 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP8B1O43520 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.7 ms