Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROM1O43490 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PROM1O43490 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PROM1O43490 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM1O43490 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROM1O43490 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM1O43490 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PROM1O43490 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PROM1O43490 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM1O43490 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM1O43490 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PROM1O43490 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM1O43490 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PROM1O43490 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM1O43490 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PROM1O43490 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROM1O43490 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROM1O43490 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PROM1O43490 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROM1O43490 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PROM1O43490 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROM1O43490 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROM1O43490 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROM1O43490 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PROM1O43490 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROM1O43490 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PROM1O43490 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROM1O43490 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROM1O43490 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PROM1O43490 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM1O43490 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM1O43490 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PROM1O43490 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM1O43490 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PROM1O43490 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM1O43490 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PROM1O43490 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PROM1O43490 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM1O43490 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM1O43490 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM1O43490 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROM1O43490 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PROM1O43490 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROM1O43490 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PROM1O43490 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PROM1O43490 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PROM1O43490 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PROM1O43490 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PROM1O43490 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROM1O43490 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROM1O43490 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROM1O43490 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROM1O43490 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PROM1O43490 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROM1O43490 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PROM1O43490 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROM1O43490 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROM1O43490 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROM1O43490 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PROM1O43490 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM1O43490 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM1O43490 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM1O43490 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM1O43490 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM1O43490 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM1O43490 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM1O43490 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM1O43490 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM1O43490 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM1O43490 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM1O43490 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM1O43490 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM1O43490 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM1O43490 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM1O43490 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM1O43490 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM1O43490 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM1O43490 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM1O43490 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM1O43490 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM1O43490 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM1O43490 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PROM1O43490 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM1O43490 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM1O43490 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM1O43490 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM1O43490 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PROM1O43490 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM1O43490 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM1O43490 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROM1O43490 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM1O43490 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM1O43490 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROM1O43490 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms