Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRTM2O43300 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRTM2O43300 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRRTM2O43300 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRTM2O43300 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRTM2O43300 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRTM2O43300 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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