Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MAP3K13O43283 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAP3K13O43283 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAP3K13O43283 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K13O43283 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAP3K13O43283 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MAP3K13O43283 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MAP3K13O43283 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms