Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOCS6O14544 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOCS6O14544 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOCS6O14544 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SOCS6O14544 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOCS6O14544 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SOCS6O14544 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms