Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXLO00592 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PODXLO00592 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PODXLO00592 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PODXLO00592 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PODXLO00592 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PODXLO00592 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PODXLO00592 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PODXLO00592 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PODXLO00592 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXLO00592 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXLO00592 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PODXLO00592 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXLO00592 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXLO00592 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXLO00592 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXLO00592 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PODXLO00592 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXLO00592 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXLO00592 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXLO00592 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PODXLO00592 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PODXLO00592 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PODXLO00592 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXLO00592 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXLO00592 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PODXLO00592 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXLO00592 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PODXLO00592 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXLO00592 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXLO00592 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXLO00592 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXLO00592 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PODXLO00592 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXLO00592 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXLO00592 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PODXLO00592 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXLO00592 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PODXLO00592 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXLO00592 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXLO00592 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PODXLO00592 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PODXLO00592 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PODXLO00592 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXLO00592 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXLO00592 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXLO00592 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PODXLO00592 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXLO00592 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PODXLO00592 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PODXLO00592 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PODXLO00592 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PODXLO00592 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PODXLO00592 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PODXLO00592 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXLO00592 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXLO00592 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PODXLO00592 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PODXLO00592 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PODXLO00592 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXLO00592 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXLO00592 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PODXLO00592 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXLO00592 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXLO00592 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXLO00592 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PODXLO00592 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PODXLO00592 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PODXLO00592 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PODXLO00592 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PODXLO00592 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PODXLO00592 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PODXLO00592 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PODXLO00592 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PODXLO00592 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PODXLO00592 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PODXLO00592 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PODXLO00592 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PODXLO00592 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PODXLO00592 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PODXLO00592 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PODXLO00592 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PODXLO00592 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PODXLO00592 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PODXLO00592 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PODXLO00592 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PODXLO00592 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PODXLO00592 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PODXLO00592 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PODXLO00592 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PODXLO00592 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PODXLO00592 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PODXLO00592 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PODXLO00592 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PODXLO00592 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PODXLO00592 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PODXLO00592 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PODXLO00592 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PODXLO00592 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PODXLO00592 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms