Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLOD2O00469 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLOD2O00469 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLOD2O00469 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLOD2O00469 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD2O00469 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD2O00469 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD2O00469 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms