Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE2AO00408 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE2AO00408 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE2AO00408 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDE2AO00408 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDE2AO00408 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDE2AO00408 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDE2AO00408 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms