Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
O00370 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
O00370 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
O00370 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
O00370 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
O00370 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
O00370 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
O00370 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
O00370 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
O00370 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
O00370 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
O00370 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
O00370 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
O00370 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
O00370 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
O00370 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
O00370 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
O00370 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
O00370 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
O00370 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
O00370 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
O00370 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
O00370 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
O00370 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
O00370 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
O00370 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
O00370 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
O00370 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
O00370 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
O00370 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
O00370 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
O00370 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
O00370 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
O00370 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
O00370 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
O00370 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
O00370 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
O00370 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
O00370 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
O00370 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
O00370 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
O00370 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
O00370 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
O00370 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
O00370 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
O00370 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
O00370 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
O00370 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
O00370 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
O00370 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
O00370 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
O00370 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
O00370 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
O00370 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
O00370 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
O00370 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
O00370 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
O00370 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
O00370 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
O00370 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
O00370 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
O00370 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
O00370 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
O00370 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
O00370 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
O00370 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
O00370 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
O00370 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
O00370 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
O00370 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
O00370 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
O00370 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
O00370 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
O00370 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
O00370 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
O00370 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
O00370 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
O00370 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
O00370 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
O00370 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
O00370 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
O00370 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
O00370 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
O00370 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
O00370 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
O00370 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
O00370 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
O00370 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
O00370 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
O00370 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
O00370 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
O00370 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
O00370 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
O00370 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
O00370 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
O00370 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
O00370 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
O00370 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
O00370 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
O00370 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms