Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QQQ9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
J3QQQ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
J3QQQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
J3QQQ9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QQQ9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
J3QQQ9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QQQ9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QQQ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
J3QQQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QQQ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QQQ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
J3QQQ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QQQ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
J3QQQ9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QQQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QQQ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QQQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QQQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
J3QQQ9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QQQ9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
J3QQQ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QQQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
J3QQQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QQQ9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QQQ9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QQQ9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QQQ9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QQQ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
J3QQQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QQQ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QQQ9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QQQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QQQ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QQQ9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QQQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QQQ9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QQQ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QQQ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QQQ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QQQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QQQ9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QQQ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QQQ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QQQ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
J3QQQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QQQ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QQQ9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QQQ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QQQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QQQ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QQQ9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QQQ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QQQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QQQ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QQQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QQQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QQQ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QQQ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QQQ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QQQ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QQQ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QQQ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QQQ9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QQQ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QQQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QQQ9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QQQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QQQ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QQQ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QQQ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QQQ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QQQ9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QQQ9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QQQ9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QQQ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QQQ9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QQQ9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QQQ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QQQ9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QQQ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QQQ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QQQ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QQQ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QQQ9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QQQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms