Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
J3KR12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
J3KR12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
J3KR12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
J3KR12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
J3KR12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
J3KR12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
J3KR12 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
J3KR12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
J3KR12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
J3KR12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
J3KR12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
J3KR12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
J3KR12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
J3KR12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
J3KR12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
J3KR12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
J3KR12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
J3KR12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
J3KR12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
J3KR12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
J3KR12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
J3KR12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
J3KR12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
J3KR12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
J3KR12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
J3KR12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
J3KR12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
J3KR12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
J3KR12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
J3KR12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
J3KR12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
J3KR12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
J3KR12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
J3KR12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
J3KR12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
J3KR12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
J3KR12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
J3KR12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
J3KR12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
J3KR12 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
J3KR12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
J3KR12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
J3KR12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
J3KR12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
J3KR12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
J3KR12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
J3KR12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
J3KR12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
J3KR12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
J3KR12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
J3KR12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
J3KR12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
J3KR12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
J3KR12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
J3KR12 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
J3KR12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
J3KR12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
J3KR12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
J3KR12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
J3KR12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
J3KR12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
J3KR12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
J3KR12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
J3KR12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
J3KR12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
J3KR12 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
J3KR12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
J3KR12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
J3KR12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
J3KR12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
J3KR12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
J3KR12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
J3KR12 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27■■□□□ 1.91
J3KR12 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
J3KR12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
J3KR12 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
J3KR12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
J3KR12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
J3KR12 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
J3KR12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
J3KR12 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
J3KR12 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
J3KR12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
J3KR12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
J3KR12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
J3KR12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
J3KR12 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
J3KR12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
J3KR12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
J3KR12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
J3KR12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
J3KR12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
J3KR12 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms