Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC188H7C350 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC188H7C350 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC188H7C350 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC188H7C350 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC188H7C350 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC188H7C350 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC188H7C350 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC188H7C350 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC188H7C350 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC188H7C350 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC188H7C350 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC188H7C350 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC188H7C350 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC188H7C350 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC188H7C350 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC188H7C350 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC188H7C350 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC188H7C350 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC188H7C350 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC188H7C350 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC188H7C350 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC188H7C350 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC188H7C350 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC188H7C350 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms