Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BN98 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BN98 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BN98 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BN98 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BN98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BN98 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BN98 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BN98 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BN98 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BN98 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BN98 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BN98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BN98 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BN98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BN98 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BN98 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BN98 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BN98 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BN98 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BN98 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BN98 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BN98 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BN98 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BN98 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BN98 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BN98 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BN98 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BN98 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BN98 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BN98 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BN98 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BN98 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BN98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BN98 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BN98 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BN98 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BN98 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BN98 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BN98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BN98 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BN98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BN98 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BN98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BN98 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BN98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BN98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BN98 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BN98 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BN98 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BN98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BN98 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BN98 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BN98 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BN98 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BN98 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BN98 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BN98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BN98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BN98 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BN98 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BN98 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BN98 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BN98 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BN98 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BN98 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BN98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BN98 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BN98 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BN98 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BN98 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BN98 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BN98 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BN98 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BN98 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BN98 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BN98 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BN98 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BN98 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BN98 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BN98 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BN98 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BN98 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BN98 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BN98 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BN98 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BN98 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BN98 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BN98 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BN98 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BN98 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BN98 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BN98 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BN98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BN98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BN98 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BN98 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BN98 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BN98 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BN98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms